Durante los años siguientes, el grupo vagó sin un rumbo fijo, realizando unas pocas actuaciones por la península, tres conciertos en Alemania, y uno en Salónica (Grecia) de la mano de la Bienal de Valencia. En este tiempo, sufren además varios cambios en la formación, con la salida de Dani Arlandis, que sería sustituido por José Blasco, hermano de Andrés; poco después, José abandonaría el grupo para formar Marat-Sade, entrando en su lugar Santi Serrano.

En 1991 lanzan con el sello Triquinoise Producciones su último disco, grabado en los Estudios Pertegás de Chirivella, con la colaboración de Vicente Chust, antiguo integrante de Video; el álbum no tendría mucha repercusión, pero les abriría las puertas a realizar nuevas actuaciones por el Reino de Valencia y alrededores. A finales de este año, su canción "La Luna-Hiena" es incluida en el recopilatorio "Rock'n'Babia", dedicado a la mítica sala valenciana Babia Bar, por la que circularon algunos de los mejores grupos valencianos de los años 80.



Dos años después, en 1993, participan en el recopilatorio de Triquinoise Producciones "Déficit", con el nuevo tema "Usufructus"; para su grabación, cuentan con la colaboración a la batería de Víctor "Anex", antiguo integrante de Interterror y La Resistencia, en sustitución de Santi Serrano. Ese mismo año, el grupo se despediría con un sensacional concierto en L'Eliana, el 6 de agosto de 1993; de sus componentes, solo Manolo Fernández y Andrés Blasco continuarían en el mundo de la música, pasando Manolo por Malasangre, y Andrés por Fitzcarraldo, Doctor Truna (o simplemente Truna) y Antorcha Amable, junto a Begoña Tena.

El 29 de enero de 2010, Carmina Burana volvió a reunirse para ofrecer un único concierto en la sala Matisse de Valencia, compartiendo escenarios con el quinteto valenciano Lülla.

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